日本サッカー協会主催の天皇杯は、各都道府県予選さえ突破すれば高校生チームも出場可能である。
ただし高体連所属の高校サッカー部のみではなく、各県都道府県2種登録チーム全て、つまり、高校サッカー部の他にクラブユースにも門戸が開かれている。
クラブユースは大都市圏に集中している傾向が強く、2種登録チームをどう都道府県予選に参加させるかは、当該都道府県により事情が異なる。
また特にこの点に関しては、高校サッカー部の年間スケジュールの関係もあり、天皇杯に特化した予選を行うのは難しい事情もあり、2種登録チームの天皇杯予選出場校の条件を他の大会（JFAプリンスリーグU-18など）の成績と兼用にしている都道府県が多い。
